Etimologia denumirii orasului Aiud este destul de nuantata întrucât începând din secolul al XIII – lea nici un document oficial nu se pronunta consecvent în acest sens. Astfel se întâlnesc pentru aceeasi localitate denumiri latinesti, grecesti, germane, maghiare sau maghiarizate: Colonia ANNIA sau AD – ANNIAM; AEGIDIOPOLIS; STRASSBURG AM MIERESCH; ENILD, ENID, ENUD, ENUGD; VILLA AEGYIDI; VILLA DE ENUDIO; NOGENYD; VIA AEGIDIUS; MAIOR ENYED; GROSS ENYED; NAGY ENYED.

În harta lui Castorius printre cele 45 de localitati de pe teritoriul Daciei apare si BRUCLA, cea mai apropiata localitate de actualul Aiud. O ipoteza este ca Aiud ar deriva prin anagramare de la numele lui Iuda Tadeul, în cinstea caruia s-a ridicat biserica “Villa Iudae Thadae” (1839). AIUD, apare ca denumire în limba româna în 1854, dupa ce în 1839 era AJUDU si în 1850 AJUD. Localitatile apartinatoare orasului sunt mentionate si ele în timp sub diferite denumiri.